研究负责人兼CCFI主任Rajeev Varshney教授
由于发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)上的开创性国际基因组学研究,使得能够更好地抵御干旱、盐碱和病虫害的全新作物品种变得触手可及。
这项名为“用端粒到端粒基因组组装解锁植物遗传学”的研究由默多克大学作物和食品创新中心(CCFI)的研究人员领导。
完整的端粒到端粒 (T2T) 组装使科学家能够绘制整个基因组图谱,以支持分子育种,从而提高植物在压力条件下的性能。
研究负责人兼CCFI主任Rajeev Varshney教授表示,基因组组装的发现代表了遗传学的未来。
“基因组组装本质上就像一块一块地拼图。T2T基因组组装提供了整个基因组的完整、端到端的图片,“Varshney教授说。
“我们的工作是确保基因组中的数千个基因沿着整个染色体以正确的顺序组装在一起,并且每个部分都完美地结合在一起。
第一作者和CCFI研究员Vanika Garg博士说,现在基因测序的准确性水平已经导致了这一突破。
“到目前为止,T2T基因组组装还是不可能的,不完整的基因测序会导致错误,例如错误注释,”Garg博士说。
“这意味着负责某些理想性状的基因被遗漏了。但是由于测序技术的进步,我们终于可以为任何作物物种进行T2T基因组组装。
Varshney教授和他的研究团队目前正在与来自澳大利亚、英国、德国、美国和中国的几个实验室合作,为小麦、鹰嘴豆、蚕豆、木瓜、百香果、奶油苹果、香蕉和菠萝等几种作物开发T2T基因组组装或几乎完整的基因组组装,作为谷物研究与开发公司支持的研究项目的一部分。 和园艺创新。
“与我们的国家和国际合作者一起,我们正在几种作物中应用T2T基因组组装的方法,并且非常兴奋地看到这如何推动澳大利亚和国外的农业研究,”Varshney教授说。
“端粒到端粒基因组组装允许进入难以测序的区域,这开辟了无数开创性的研究可能性,例如创造全新的作物品种来满足我们未来的需求。”